文章摘要:本研究旨在探索序列变异对miR-378的结构、表达水平以及靶标关系的影响。利用PCR测序比对不同猪种miR-378的序列突变，预测突变对miR-378二级结构和自由能的改变；构建miR-378表达载体检测突变对其加工过程中各级产物表达水平的作用；运用TargetScan和TargetRank对突变引起的靶标关系变化进行分析；采用microRNA pull-down技术验证突变对靶标关系的影响。结果发现，在荣昌猪和内江猪群体内pre-miR-378的+49和+68位均发生A>G的序列变异，且改变了pre-miR-378的二级结构和自由能；这两个位点突变后影响了pri-miR-378到pre-miR-378的加工过程，提升了pre-miR-378和成熟体miR-378的表达水平；同时+49/A>G的突变改变了miR-378的功能及其靶标关系，其中GDF6和RAB10分别为突变后获得和缺失的靶基因，而Runx1t1、Galnt3为不受突变影响的靶基因。本研究的结果强调了miRNAs序列变异的重要性及其对miRNAs生物发生和功能的显著影响。

文章关键词:miR-378,序列变异,生物发生,靶基因,

项目基金:国家自然科学基金面上项目（31771376）,

论文作者:张廷焕 郭宗义 柴捷 潘红梅 张亮 陈磊 龙熙 

作者单位:重庆市畜牧科学院 内江猪研究所 农业部养猪科学重点实验室 

论文DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2021-0137

论文分类号: Q811.4

相似文献:miR-378促进脂质生成相关靶基因鉴定.....作者:张廷焕,龙熙,郭宗义,柴捷,刊载期刊：《生物技术通报》

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