文章目录

1 材料和方法

1.1 收集数据

1.2 差异表达的miRNA

1.3 预测DEmiRNAs的靶基因

1.4 靶基因富集分析

1.5 蛋白互作网络与模型的构建

2 结果

2.1 DEmiRNAs的分析结果

2.2 制作miRNA-靶基因调控网络

2.3 GO各项与KEGG通路的富集分析

2.4 PPI构建与核心基因的筛选

3 讨论

3.1 DEmiRNAs分析

3.2 靶基因分析

3.3 OP与AD的关系

文章摘要:目的利用生物信息学分析骨质疏松症与阿尔茨海默症差异表达的miRNA及两病的相互关系。方法利用GEO数据库获取骨质疏松症（osteoporosis,OP）与阿尔茨海默症（Alzheimer’s disease,AD）的基因芯片,使用GEO2R在线分析得到OP与AD差异表达的微小核糖核酸（differentially expressed microRNA,DEmiRNA）,将筛选后的DEmiRNAs用miRDB数据库和Targetscan数据库进行靶基因预测;用DAVID数据库对靶基因进行GO分析和KEGG信号通路分析,并结合STRING数据库,制作蛋白互作网络和DEmiRNAs-mRNA调控网络。结果 OP与AD的基因芯片中共有9个有意义的DEmiRNAs,通过蛋白互作网络筛选出前10个核心基因为:COL1A1、VEGFA、COL4A1、COL3A1、COL5A1、COL2A1、LOX、COL7A1、IGF1、COL5A2,同时发现hsa-miR-29b-3p和胶原蛋白在两病中的关系最为密切。结论通过研究两种疾病DEmiRNAs与核心基因有助于了解OP与AD的相互关系,了解两病共同的发病机理,为两病治疗提供新的思路与方向。

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